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基于miRNA-TF调控网络识别乳腺癌亚型关键调控子
目的 挖掘乳腺癌各亚型关键调控子并评估其预后能力.方法 整合TCGA数据库中乳腺癌样本基因表达、拷贝数变异和DNA甲基化数据,分亚型筛选癌症相关基因.以此为基础,挖掘各亚型的四类motif,将同亚型四类motif合并构建各亚型miRNA-TF调控网络.随后,挖掘每个网络hub节点,并对其预后能力进行评估.结果 各调控网络中的10个hub miRNA分别为乳腺癌亚型关键调控子.结论 基于miRNA-TF调控网络能有效识别出乳腺癌亚型预后相关生物标志物.
关键词： 乳腺癌亚型 miRNA-TF调控网络 miRNA -
新辅助化疗对乳腺癌肿瘤蛋白的影响
目的:探讨乳腺癌肿瘤蛋白在新辅助化疗(neoadjuvant chemotheapy,NAC)前后的变化.方法:对我院2012年至2013年间接受NAC(方案为:多西他赛+表柔比星/吡柔比星+环磷酰胺)的112例乳腺癌患者的肿瘤蛋白表达情况进行分析,比较NAC前后肿瘤蛋白的具体变化情况.结果:肿瘤蛋白从阳性转为阴性变化率高的是Ki-67 (37.5％),雌激素受体(estrogen receptor,ER)和P53变化率低,均为16.1％.而从阴性转为阳性变化率高为P53(13.3％),低是Ki-67(2.7％).ER(P=0.043)、Ki-67 (P＜0.001)和人类表皮生长因子受体(human epidermal growth factor receptor-2,HER2,P=0.035)和乳腺癌亚型(P＜0.001)的变化具有统计学意义.Ki-67平均表达率的变化有统计学意义(P＜0.001).年龄＞50岁与Ki-67的阳转阴的变化相关,肥胖和淋巴结转移的患者容易出现HER2阳转阴的变化.结论:NAC能引起肿瘤蛋白的改变,年龄、体质指数(body mass index,BMI)、淋巴结转移和T分期等因素与肿瘤蛋白的变化具有一定的相关性.
