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中国绿水螅分子系统发生地位的初步探讨
目的:初步探讨中国绿水螅(Hydra smensis)分子系统发生地位以及水螅属内部各类群系统发生关系.方法:采用酚-氯仿法提取中国绿水螅总DNA,扩增线粒体COI和16S rRNA基因片段并进行DNA序列测定,再利用Clustal及MEGA等生物信息学分析软件进行系统发生分析.结果:在本研究重建的所有系统发生树中,中国绿水螅始终与绿水螅Hydra viridissima的不同种群一起构成绿水螅单系群.同时,棕色水螅群的单系性被基于COI基因的NJ树以及基于16S rRNA基因的NJ树和ML树支持,唯独基于COI基因的ML树不支持棕色水螅群的单系发生.在基于COI基因的ML树中纤弱水螅族在系统树的基部独立为一支系,而绿水螅群和其他棕色水螅群水螅一起组成另一支系,提示纤弱水螅族水螅的系统发生地位值得进一步探讨.值得注意的是,根据本文的结果,棕色水螅群内3族的划分仍然有一定疑问.基于COI基因的NJ树和ML树支持普通水螅族、寡水螅族和纤弱水螅族各自族内的单系发生,但16S rRNA基因的NJ树和ML树中仅普通水螅族水螅聚为单系群,而寡水螅族和纤弱水螅族水螅各自并非单系发生.结论:把水螅属划分为绿水螅群及棕色水螅群有一定的合理性,但棕色水螅群内寡水螅族、普通水螅族和纤弱水螅族3族的划分还有待商榷.
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基于线粒体16S rDNA序列的深圳水库区双脐螺分子鉴定
目的 基于线粒体16S rDNA序列对深圳水库区双脐螺进行分子鉴定.方法 以双脐螺基因组DNA为模板,聚合酶链反应扩增16S rDNA目的基因片段,并以pMD18-T载体克隆后进行序列测定,采用BLAST和MEGA4软件分析序列特征.结果 双脐螺线粒体16S rDNA扩增片段大小约为466 bp;测定序列与GenBank中1株巴西藁杆双脐螺(Biomphalaria straminea,B.straminea)同源性为99％;与3株库恩双脐螺(B.kuhniana)同源性均为98％;与l株中介双脐螺(B.intermedia)和l株双脐螺(B.edisoni)的同源性分别为95％和94％.深圳水库区2株双脐螺与巴西藁杆双脐螺(序列号AY030213.1)的遗传距离为0;基于16S rDNA序列,采用MEGA4软件作系统发生分析,以邻位连接法(NJ)和非加权组平均法(UPGMA)构建的系统发生树,水库区双脐螺与该藁杆双脐螺属于同一个分支.结论 根据16S rDNA序列特征,深圳水库区双脐螺可归类为藁杆双脐螺.
