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正常与异常核型人类胚胎干细胞体外分化不同时期基因表达的异同
目的:研究正常核型和异常核型人胚胎干细胞(hESC)基因的表达异同.方法:实时荧光相对定量PCR检测两株正常核型(46,XX)及一株平衡易位13三体核型和一株三倍体核型hESC在体外自体分化不同时期X连锁基因PGK1、抑癌基因RBBP7及癌症基因GPC4的表达情况,并比较分化后不同时期、不同核型对父系印迹基因H19、IGF2R,母系印迹基因SNRPN及多能性调控基因OCT4、NANOG的影响.结果:随着分化时间的增加:①正常和异常核型hESC的PGK1均上调表达;②异常核型hESC抑癌基因RBBP7及癌症基因GPC4相对正常核型hESC呈现明显上调表达;③正常和异常核型hESC中印迹基因表达基本一致:H19、IGF2R上调而SNRPN表达变化不明显或下调;④多能性调控基因OCT4、NANOG在正常核型hESC中较在异常核型hESC中表达明显下降.结论:X连锁基因PGK1、印迹基因在hESC的发育过程中能维持正常调节而不受核型的影响.异常核型hESC抑癌基因、癌症基因在发育过程中的表达上调表明此种细胞具有更危险的发育前景,同时多能性基因在分化后仍能检出表明此种细胞分化能力较正常细胞弱.
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Nature Genetics:膀胱肿瘤基因组突变中DNA修复的关键角色
来自美国麻省理工学院和哈佛大学的研究者对尿路上皮肿瘤进行深度基因组分析发现:ERCC2核苷切除修复酶基因突变与特定的基因组标记密切相关,该标记还与吸烟高度关联;揭示出DNA损伤和后续的修复在癌症基因组突变全景(landscape)的形成过程中发挥重要作用.成果在线发表在《自然·遗传学》(KIM J,MOUW KW,POLAK P,et al.Somatic ERCC2 mutations are associated with a distinct genomic signature in urothelial tumors.Nature Genetics,doi:10.1038/ng.3557,2016)杂志上.
