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基于分子互作网络的MMP s相关基因在胃癌组织中的表达研究
目的：探讨 MMPs相关分子互作网络在胃癌组织中的表达情况。方法运用10对胃癌及相应癌旁组织芯片筛选胃癌组织中差异表达基因，结合 BioGRID数据库，构建胃癌组织中表达异常的 MMPs相关分子互作网络。结果胃癌中多个 MMPs家族成员及其互作网络中的18个基因均呈高表达状态，主要参与的生物学过程及通路和癌症细胞的侵袭、转移等过程密切相关。结论高通量组学及相关数据库、分析工具的结合有助于构建癌症中表达异常的分子互作网络，为后续的研究提供较全面的分子学机制基础。
关键词： 分子互作网络 MMPs BioGRID数据库 GO Pathway -
泛素-蛋白酶体通路与神经生长因子家族的肿瘤相关性研究进展
泛素化是蛋白质翻译后重要修饰之一,是蛋白质降解信号,被泛素化修饰的蛋白质被蛋白酶识别从而被降解.近年来,人们通过对泛素化-蛋白酶体通路研究的深入,发现其是细胞内蛋白质选择性降解的主要途径,参与细胞凋亡、MHCⅠ类抗原的递呈、细胞周期以及细胞内信号传导等过程,对维持细胞的稳态具有极其重要的意义[1].在细胞周期中,细胞内蛋白质的产生和降解保持着动态平衡,如果这一动态平衡被破坏,就会造成严重的细胞增殖或分化的异常,进而导致多种疾病的发生.
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CDICdb:一个疾病-离子通道关联库
离子通道是镶嵌在生物膜上的蛋白质,提供了离子出入膜的生物孔道.它们不但与许多基本的生理功能相关,现有研究发现它们还与许多疾病的发生发展有密切的关系.疾病-离子通道关联库(DataBase of Correlations between Disease and Ion Channel,CDICdb)实现了依据离子通道查询相关的疾病,以及依据疾病查询相关离子通道和离子通道关联的KEGG库中Pathway通路的信息的功能.利用本数据库提供的关联网络,研究人员可以对离子通道病有更全面的认识.CDICdb是一个关系型数据库,现在可以免费地使用,网址为:http://db.cdicdb.com/channel2disease/index.html.
