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未知的基因型文献资料
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尿道致病性大肠埃希菌UPEC4030株papA基因的克隆和序列分析
目的 比较尿道致病性大肠埃希菌UPEC4030株papA与相关序列的差异,明确是否为未知的基因型.方法 采用PCR扩增、基因克隆与测序分析方法,分别对UPEC4030株papA进行基因与氨基酸序列分析,并与相关序列进行比较.结果 UPEC4030 papA由722个碱基对组成,编码192个氨基酸的多肽.与10个基因型UPECpapA核苷酸序列和推导的氨基酸序列进行同源性比较,结果分别为36.11%~77.95%和22.20%~78.34%;与papA基因分型多重PCR引物序列比较,下游分型引物在UPEC4030papA相应位置上的序列同源性只有10%~66.67%,推测该菌株papA为未知的基因型.结论 UPEC4030 papA为未知的基因型,相关致病机制和流行病学意义值得深入研究.
关键词: 尿道致病性大肠埃希菌 基因测序 未知的基因型