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图论主成分分析文献资料
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人类群体遗传结构的图论主成分分析方法
目的提出基因频率矩阵的图论主成分分析方法,探讨该法在人类群体遗传结构研究中的应用.方法 从分析基因频率矩阵的结构特征入手,将主成分分析与图论中的小生成树有机结合,构建人类群体遗传结构的图论主成分模型,并以中国26个汉族人群HLA-A基因座遗传结构分析为例,验证图论主成分分析的科学性和适用性.结果 图论主成分分析的基本步骤可概括为:①对中心化基因频率的协方差矩阵进行主成分分析;②按图论原理求过m维空间n个点的小生成树;③利用求"颈"法分割小生成树;④将小生成树整合到二维主成分散点图中构建图论主成分分类图.根据此步骤,对中国26个汉族人群HLA-A基因座遗传结构进行了图论主成分分析,分析结果符合中华民族源与流的客观规律.结论图论主成分分类图既可显示各群体的遗传结构特性,又可利用小生成树的链接关系揭示各群体间的内在联系;图论主成分分析是分析人类群体遗传结构的一种较好方法.
