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肠道病毒71(EV71)型文献资料
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宁波市肠道病毒71型分离株全基因序列对比分析
目的 探讨浙江宁波地区2010年分离的肠道病毒71型( EV71)中神经毒性相关位点.方法 采集宁波地区2010年手足口病不同症状患者粪便标本,进行荧光聚合酶链反应检测,阳性标本病毒分离；分8个片段对EV71全基因序列和VP1区进行逆转录聚合酶链反应(RT - PCR)、克隆、测序、拼接、同源性比较,用DNAstar推导其内含子编码的氨基酸序列并比对分析.结果 6株分离株基因全长均为7 406 bp,核苷酸同源性为97.9％～99.4％,其中3株死亡病例标本内部核糖体进入位点(IRES)中的124、272及408位,碱基分别为T、G、A,区别于其他3株手足口轻症患者分离株的A、A和G；3株死亡病例标本位于主要衣壳蛋白VP1区的第715位氨基酸和3C蛋白酶的第1704位及1706位的氨基酸分别为甲硫氨酸(met)、精氨酸(arg)及异亮氨酸(ile),区别于3株轻症病例的亮氨酸(leu)、赖氨酸(lys)及缬氨酸(val).结论 宁波地区2010年分离的EV71 IRES、VP1与3C位点变异与EV71神经毒性相关.
关键词： 肠道病毒71(EV71)型 全基因序列 同源性
