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邯郸市2010-2012年肠道病毒71型VP1基因特征分析

郭瑞玲;闫永飞;黄亮;张治芳;郭娜娜;李晓伟;马艳霞;邓健

摘要: 目的 明确邯郸市2010-2012年EV71流行株的基因型及其VP1区基因特征,为手足口病防治提供分子生物学依据.方法 用RD细胞分离培养EV71病毒,RT-PCR方法扩增VP1区基因片段,进行核苷酸和氨基酸序列同源性分析,构建系统进化树.结果 邯郸市EV71分离株VP1区核苷酸同源性为96.4%~100.0%,与A、B基因型代表株VP1区核苷酸同源性在81.8%~82.7%与83.6%~84.5%之间.与已知基因型C1、C2、C3、C4代表株的核苷酸同源性分别在89.9%~90.3%、89.3%~90.1%、87.9%~88.7%和96.0%~96.9%之间,与1998年台湾分离株同源性为92.4%~93.2%,与2008年阜阳、2009年河南、2010年河北和2011年陕西分离的EV71代表株同源性在96.6%~99.1%之间.基于VP1区构建的EV71系统进化树显示,这14株EV71均为C4a亚型.结论 邯郸市2010-2012年EV71流行株为C4a亚型,与中国大陆近年流行株分离结果一致.

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