您当前的位置：
首页 > 文献资料
所属专业：
构象搜索文献资料
-
水飞蓟宾构象的理论研究
目的水飞蓟宾RRRR对映体分子中存在多个可变的二面角,可以产生许多立体构象,旨在从理论上寻找其合理构象.方法采用二面角系统搜索后,结合AM1方法确定主要构象,以B3LYP/6-31G*方法优化构型后,在B3LYP/3-21G水平计算了振动频率和热力学参数.结果得到了各二面角的分布情况,找出了主要的局部构象,明确了C9-C11和C18-C22旋转主要引起分子构象变化,4种主要构象能量差异较小,都有存在的可能性,二面角C19-C18-C22-C32和C8-C9-C11-C16变化的能量曲线表明,C9-C11旋转的能垒很小,受C19的羟甲基影响,C18-C22旋转能垒较大.结论水飞蓟宾RRRR对映体主要以4种构象的形式存在.
-
蛋白质-核酸对接方法研究进展
分子对接技术作为预测蛋白质-核酸复合物结构的有效方法,为研究在生物学过程中蛋白质-核酸的相互作用提供了重要的工具.本文首先分析了当前蛋白质-核酸对接研究中的主要困难,例如构象变化和核糖磷酸骨架的带电性问题.然后从构象搜索、打分函数、柔性策略三个方面比较和总结了蛋白质-核酸对接中主要的计算方法.后回顾了蛋白质-核酸对接计算模型的应用,并对未来的工作进行了展望.
