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Coxsackievrius A16文献资料
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2017年北京市东城区EV-A71和CV-A16分离株VP1基因序列特征分析
目的 通过分析北京市东城区2017年手足口疑似病例样本中肠道病毒A组71(enterovirus 71,EV-A71)和柯萨奇病毒A组16型(coxsackievrius A 16,CV-A16)毒株VP1基因序列特征,为手足口病的防治提供基础资料.方法 利用RT-PCR法对分离得到的EV-A71和CV-A16 VP1序列进行扩增和测序,利用DNAstar5.0和MEGA6.0软件对EV-A71和CV-A16的VP1序列进行比对分析并构建系统发育树.结果 2017年东城区共检测手足口疑似病例咽拭子95份,肠道病毒阳性46份(占48.42％);其中EV-A71阳性4份(占4.21％),CV-A16阳性4份(占4.21％),非EV-A71非CV-A16的其他肠道病毒阳性38份(占40.00％).4株EV-A71分离株核苷酸和氨基酸序列同源性分别为92.89％～99.15％和97.32％～98.66％;3株CV-A16分离株核苷酸和氨基酸序列同源性分别为93.90％～98.76％和98.32％～100.00％.系统进化树显示4株EV-A71属于C4a基因亚型,3株CV-A16属于Blb基因亚型.结论 北京市东城区2017年引起手足口病的病原主要以非EV-A71非CV-A16的其他肠道病毒为主,但是EV-A71和CV-A16仍占一定比例.EV-A71毒株属于C4a基因亚型;CV-A16毒株属于Blb基因亚型;与近年来中国大部分地区毒株的基因分型一致;没有检测到新亚型.
