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基于叶绿体matK基因序列探讨10种石杉科石杉属植物的系统关系及分子鉴定
目的:利用叶绿体matK基因序列探讨10种石杉属植物的系统发育及分子鉴定.方法:分别从9种石杉属植物中提取总DNA,经扩增纯化后,用PCR产物直接测序.结果:对石杉属Huperzia Bernh.9个种的叶绿体matK基因进行了测序,序列长度为1 589 bp,并对10个种(亮叶石杉H.lucidula的matK基因序列从GenBank中下载)的matK序列进行比对,其中有35个系统发育信息位点及35个变异位点,以垂穗石松Lycopodiella cernua为外类群,利用MEGA 3.1软件计算种与种之间的遗传距离在1.59%～0.25%,并构建系统树,获得简约树和邻接树.结论:小杉兰组和蛇足石杉组植物分别聚成一枝,构成姊妹群,其靴带支持率分别为98%和99%.长柄石杉与蛇足石杉分别聚在2个不同进化枝,二者间有19个碱基差异,遗传距离为1.21%.建议应将长柄石杉单独列为一个种.
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DNA条形码鉴定研究
目的 探究应用DNA条形码对大黄类药物分类的效果.方法 提取四川、甘肃、青海、西藏、云南、宁夏6省份的40份样品叶绿体matK基因序列进行PCR扩增,将不同产地大黄的matK基因进行对比,以进行鉴定工作.结果 将提取的基因序列进过严格仔细的对比,能够发现40类样品中细微的差别.结论 通过DNA条形测序工作可以对大黄进行明确的品种分类.
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中日产川芎的matK、ITS基因序列及其物种间的亲缘关系
目的分析中国产川芎Ligusticum chuanxiong Hort.及日本产川芎Cnidium officinale Makino的核基因组ITS和叶绿体基因组matK序列,为探讨中日产川芎物种间的亲缘关系提供分子依据.方法采用PCR直接测序技术测定川芎和日本川芎的ITS基因和matK基因核苷酸序列并作序列变异分析.结果川芎和日本川芎的matK序列长度均为1268 bp,编码422个氨基酸.ITS1-5.8S-ITS2序列长度均为699 bp,其中18S rRNA基因3′端序列54 bp,ITS1序列215 bp,5.8S rRNA基因序列162 bp,ITS2序列222 bp,26S rRNA基因5′端序列46 bp.根据排序比较,川芎原植物与其商品药材间的matK基因和ITS基因序列完全相同,而川芎与日本川芎间matK基因则仅有1个变异位点,即在上游959 nt处1个转换替代(T→C),反映在氨基酸序列则发生一个非同义取代V(GTG)→A(GCG);ITS基因也仅有1个变异位点,即在ITS1上游54 nt处1个转换替代(T→C).结论通过进化速率较快的基因序列同源性分析,基本可以认为中日所产川芎基原一致,日本川芎学名似应改为Ligusticum chuanxiong Hort..
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广藿香与土藿香的DNA序列分析及其分子鉴别
目前市场上藿香类商品药材有两种,一种为唇形科刺蕊草属(Pogostemon)植物广藿香Pogostemon cablin (Blanco) Benth.的干燥地上部分,主产广东、海南,习称"广藿香",均为栽培品,有芳香化浊、开胃止呕、发表解暑的功效,是中成药"藿香正气水"的主要原料.
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蛇床子地理分布与叶绿体matK基因序列的相关性分析
目的探讨中药蛇床子Cnidium monnieri(L.)Cuss.居群间的DNA序列变异与地理分布的关系,为蛇床子品质评价提供分子依据.方法采用PCR直接测序技术对蛇床子6个居群6个个体样品的叶绿体matK基因进行测序分析研究.结果蛇床子6个居群的matK基因核苷酸序列长1268 bp,编码422个氨基酸成熟酶.根据排序比较,蛇床子6个居群间的matK基因序列存在12个变异位点,氨基酸序列10个变异位点.邻接法构建的系统分支树表明:蛇床子居群间的亲缘关系与地理分布及所含香豆素化学型呈良好的相关性.结论结合香豆素分析数据,基因测序分析技术可以成为蛇床子品质评价的有力工具.
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石斛及其常见混淆品的matK基因序列比较
目的比较几种药典收载石斛与常见市场混淆品种的matK基因序列,为石斛类药材的鉴定提供分子依据.方法PCR扩增、测序、PAUP软件分析.结果非石斛属的几种混淆品与正品石斛间的matK基因序列差异远大于正品石斛间的差异,PAUP 4.0构建的树型图亦显示几种石斛属植物聚在一起,而非石斛属植物聚在外方.结论通过matK基因序列可以分析石斛及其混淆品间的遗传关系,将正品与混淆品区别开来.
