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结核病患者血清中Small RNAs表达谱分析
目的 了解结核病患者血清中Small RNA(sRNA)表达谱的特征,为从Small RNA角度探讨结核病发生、发展的调控机制奠定基础.方法 采用Solexa深度测序技术得到包括miRNA、siRNA、piRNA、rRNA、tRNA、snRNA、snoRNA、repeat associate sRNA、exon或intron降解片段等在内的所有Small RNA.通过与已知数据库进行比对、寻找样品与数据库之间在基因组位置上的overlap等方法,对sRNA进行注释,同时选取没有被注释上的sRNA,使用华大自主开发的软件Mireap预测novel miRNA.结果 非结核病组血清中发现109 630种、2 759 795条Small RNA,其中候选miRNA种数为84、候选miRNA总表达量为1 433;结核病组血清中发现97 614种、1 452 119条Small RNA,其中候选miRNA种数为65、候选miRNA总表达量为755.结论 结核病人与非结核病人血清中的Small RNA表达谱存在种类与数量上的差异.
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结核病患者与健康人血清蛋白质谱的比较研究
目的 比较结核病患者与健康人血清蛋白质谱,寻找结核病相关特异血清蛋白质,以期发现新型结核病血清学诊断标志物.方法 应用弱阳离子交换蛋白质芯片(WCX)和表面增强激光解吸-电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术对包括54例菌阳肺结核(菌阳组)、45例菌阴肺结核(菌阴组)、18例肺外结核(肺外组)共117例结核病患者(结核组)及62例健康对照者(对照组)进行了血清蛋白质谱检测,并应用ClinProTools分析软件进行分析,找出差异蛋白质.结果 菌阳组-对照组、菌阴组-对照组、肺外组-对照组和结核组-对照组间分别存在19、14、26和30个差异血清蛋白质,其中分别有11、9、15和15个蛋白质在患者血清中表达上调；相对分子质量分别为1060、1944、2081和3954的4个血清蛋白质为各患者组与对照组间共同存在的差异血清蛋白质,其中相对分子质量为1060的蛋白质在患者血清中表达下调.结论 结核病患者与健康人之间血清蛋白质谱存在差异,有望通过血清蛋白质谱的比较分析,寻找到结核病相关特异血清蛋白质而发现新型结核病血清学诊断标志物.但尚需大样本量、多对照系的进一步研究予以确证.
