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抗体CDR-H3区段的免疫信息学分析
抗原结合部位亲和力是其组成氨基酸理化特性、结构特征的集中体现.CDR-H3位于抗体的抗原结合部位中心,构象多变.本研究从人抗体CDR-H3的氨基酸分布序列信息入手,同时选取12个FDA已批准上市的治疗性抗体药物来分析抗体CDR-H3区段的结构特点.结果显示人H3区段高分布频率长度为12,出现概率高的氨基酸为Tyr,Tyr、Trp、Ser、Thr、Gly 5种氨基酸有助于抗原结合部位构象的形成;所选取的抗体药物CDR-H3区段的长度n∈[7,14],Base区域构象均隶属于K构型,β-发夹结构氢键分布变化各异,其中芳香族氨基酸侧链和带电氨基酸分布对抗原结合具有重要促进作用.
