首页 > 文献资料
-
BICD货物接头蛋白1基因作为胶质瘤级别进展分子标志物的研究
目的 检测BICD货物接头蛋白1(BICD1)基因在中国人群各级别胶质瘤样本中的表达水平,并探讨其在低级别胶质瘤向高级别胶质瘤进展过程中的潜在作用.方法 从中国脑胶质瘤基因组图谱(CGGA)的全转录组表达谱芯片数据库和全转录组测序数据库中收集BICD1的mRNA表达数据,结合胶质瘤的世界卫生组织(WHO)级别、分子亚型、患者无进展生存期和总生存期及经典分子标志物的表达与突变数据,分析BICD1表达与胶质瘤的级别进展及恶性程度的相关性.收集WHOⅡ、Ⅲ和Ⅳ级胶质瘤组织各10例,提取RNA并反转录为cDNA进行实时荧光定量PCR(qPCR),分析各级别胶质瘤样本中BICD1在转录水平上的表达差异.结果 CGGA全转录组表达谱芯片和全转录组测序数据库中提取的表达数据显示,BICD1的表达水平随着胶质瘤的级别升高而升高(WHOⅢ及Ⅳ级vs WHOⅡ级:t=7.901,P<0.01).qPCR结果显示较高级别的胶质瘤组织中BICD1的表达水平更高(WHOⅢ级vs WHOⅡ级:t=3.514,P<0.01;WHOⅣ级vsⅢ级:t=2.128,P=0.0376).BICD1高表达与胶质瘤患者更短的无进展生存期和总生存期均有关(P均<0.01).BICD1在前神经元型、神经元型、经典型和间质型胶质瘤样本中的表达水平不同(F=21.8,P<0.01),其中间质型胶质瘤样本中BICD1表达水平高,前神经元型胶质瘤样本中表达水平低.BICD1的表达水平与异柠檬酸脱氢酶1(IDH1)突变、染色体1p19q联合缺失、人第10号染色体缺失的磷酸酶和张力蛋白同源基因(PTEN)突变等指示胶质瘤恶性程度的经典分子标志物相关,其中IDH1突变胶质瘤样本中BICD1的表达水平低于野生型样本(t=7.769,P<0.01).结论 BICD1可能是指示低级别胶质瘤发生级别进展和恶性进展的潜在分子标志物.
关键词： 神经胶质瘤 BICD货物接头蛋白1 肿瘤分期 恶性程度 生物学肿瘤标志物 -
乳腺癌血清标志物的TMT标记定量蛋白质组学筛选及分析
目的 探讨乳腺癌患者血清中蛋白的表达变化,筛选并分析乳腺癌诊断的生物学标志物.方法 采用定量蛋白质组学串联质量标签(TMT)标记技术对68例Ⅱ期乳腺癌患者及62例健康女性的血清蛋白进行检测,并进行蛋白质定量分析,筛选乳腺癌患者血清中发生显著变化的差异蛋白.利用UniProt数据库和Proteome Discoverer软件及在线工具STRING对差异蛋白进一步行生物信息学分析,应用蛋白质印迹法和qPCR对变化倍数显著的差异蛋白VIME(上调为健康对照女性的3.918倍)和RAF1(下调为健康对照女性的0.251)进行验证.结果 共获得67种差异蛋白,其中26种表达上调,41种表达下调.基因本体论(GO)注释分析和功能聚类分析显示上述差异蛋白与肿瘤的血管生成、新陈代谢进程、生物黏附能力等相关.蛋白质印迹法和qPCR验证结果显示RAF1蛋白和mRNA在Ⅱ期乳腺癌患者血清中的表达水平均低于健康对照女性,而VIME蛋白和mRNA的表达均高于健康对照女性,与筛选结果一致.结论 定量蛋白质组学TMT法能有效筛选Ⅱ期乳腺癌患者血清中的差异蛋白,其中VIME和RAF1蛋白有望成为乳腺癌淋巴结转移的候选血清标志物.
-
MicroRNA-4286在前列腺癌诊断中的价值
目的 检测血清前列腺特异性抗原(prostate-specific antigen,PSA)升高患者microRNA-4286 (miR-4286)的表达情况,探讨其在前列腺癌诊断中的意义.方法 选择2016年3月至8月第二军医大学长海医院日间手术病区收治的171例血清PSA升高、行前列腺穿刺活检的患者,采用qPCR技术检测miR-4286在血清中的表达,比较前列腺癌(50例)和良性前列腺病变(121例)患者miR-4286表达的差异.并且分析10例良性病变患者术前与术后3d的血清miR-4286的表达变化,以及15例PCa患者的术前与术后3d及8例术前与术后7d的血清miR-4286的表达变化.以受试者工作特征曲线分析评价miR-4286对PCa的诊断效能.结果 MiR-4286在前列腺癌和良性前列腺病变患者中的表达水平差异有统计学意义(P＜0.05).术后3d前列腺癌患者miR-4286的表达水平升高,与术前相比差异有统计学意义(P＜0.05),术后3d良性前列腺病变患者miR-4286的表达水平与术前相比差异无统计学意义(P＞0.05);术后7 d miR-4286在前列腺癌患者中的表达水平与术前相比差异无统计学意义(P＞0.05).MiR-4286和PSA在前列腺癌中的诊断效能分别为曲线下面积(AUC)0.653(界值3.72,敏感性68.75％,特异性60.06％)和0.733(界值11.38ng/mL,敏感性57.16％,特异性92.35％).结论 MiR-4286在前列腺癌中具有良好的诊断价值,可作为新型的液体活检标志物.
关键词： microRNA-4286 前列腺肿瘤 诊断 生物学肿瘤标志物
