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淋巴瘤细胞释放的EXO的蛋白质组分分析
目的:分析淋巴瘤细胞释放的胞外体(lymphoma cell-derived exosomes,LCEX)的蛋白质组分.方法:利用Shotgun技术,分析淋巴瘤Raji细胞系和Raji细胞分泌的EXO中所含蛋白种类并进一步进行鉴定.利用网络数据库进行蛋白组分功能分析.结果:Raji细胞共鉴定出了蛋白322种,Raji细胞系分泌的EXO共鉴定出了蛋白197种,其中139种蛋白为二者共有,其余58种为EXO所特有.采用了GO(gene ontology数据库对Raji细胞释放的EXO蛋白功能进行了分析.①LCEX可能主要参与了对细胞内外刺激的应答及对应答的定位(包括与相关细胞之间的粘附、结合等),并参与免疫调节.②利用KEGG数据库分析发现,Raji细胞释放的EXO所负载的蛋白中涉及细胞粘附分子的有8种蛋白分子,主要为ICAM分子及MHC分子；③涉及抗原加工和提呈的有12种蛋白分子,主要是HSP70和HSP90家族的.结论:EXO负载了大部分其来源细胞的蛋白,所负载的蛋白中涉及多种参与免疫调节作用的分子,可能是淋巴瘤细胞参与肿瘤免疫的调节重要机制.
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旋毛虫成虫排泄分泌蛋白组分分析
目的 通过“鸟枪法” (shotgun技术)分析旋毛虫(Trichinella spiralis)成虫排泄分泌蛋白(adult worm excretory/secretory protein,AWESP)的组分,寻找其调节人炎症性肠炎的活性成分. 方法 制备旋毛虫AWESP,经十二烷基硫酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)分离酶解后,采用shotgun液相色谱-串联质谱系统鉴定,将分析所得的数据通过Masco软件进行数据库检索,完成蛋白的鉴定,并对鉴定出的蛋白从细胞组分、分子功能和生物学途径3个方面进行Gene Ontology (GO)分类. 结果 SDS-PAGE分离的旋毛虫AWESP相对分子质量(Mr)约15 000～116 000,质谱分析共获得280个蛋白,通过Masco软件检索已鉴定的蛋白为96种,假定的蛋白为98种,未鉴定的蛋白为86种.已初步发现至少有4种蛋白可能具有潜在的调节人炎症性肠炎的作用,包括半胱氨酸蛋白酶抑制剂、丝氨酸蛋白酶、53 000排泄/分泌抗原和谷胱氨肽转移酶.GO工具分析显示,已鉴定的蛋白具有104种分子功能,参与了363种生物过程. 结论 经Masco软件检索,旋毛虫AWESP成分复杂多样,已鉴定的蛋白有96种,从已明确的蛋白中初步筛选出4种与调节人炎症性肠炎潜在相关的蛋白.
