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芪参益气方对心肌梗死治疗作用分子机制的生物信息分析

林贯川;郑文岭;马文丽

摘要: 目的:运用生物信息学分析工具,从基因的角度阐述芪参益气方对心肌梗死治疗作用的分子机制。方法对基因表达综合数据库(Gene Expression Omnibus, GEO)进行大数据分析,采用酷核组学分析器(Qlucore Omics Explorer, QOE)进行差异基因分析,筛选出治疗作用中的功效基因分子;采用可视化基因注释系统数据库(Database for Annotation, Visualization and Integrated Discovery online Gene Annotation system, DAVID)进行基因功能富集分析,确定所筛选基因在生物进程中的功能;采用基因/蛋白质相互作用检索数据库(Gene/protein interaction database, STRING)进行分析,确定关键基因在治疗过程中分子机制网络图。结果经分析,推论出芪参益气方在对心肌梗死治疗过程中主要上调了包括NFIL3、ARNTL、DBP、FGD4等特殊基因和基因受体基因(NR1D1、NR1D2)的表达,使得生物节律基因、特定结合基因(BHLHE40/41)得到调控。结论基因层面上,芪参益气方可调控细胞再生、炎症抵抗、酶活性等相关基因的表达,使心血管和心脏代谢相关的心肌梗死得到治疗。

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