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12C6+重离子束照射人淋巴细胞蛋白质组分析
目的 探讨12C6+离子束照射对人淋巴细胞蛋白质组的影响.方法 将人淋巴细胞Peng-EBV按照射剂量分为0.1、0.5和2.0 Gy组,未照射为对照组.使用12C6+离子束进行照射,吸收剂量率为0.3～0.5 Gy/min.利用同位素标记的相对和绝对定量技术(iTRAQ)分析受照淋巴细胞的蛋白质表达,筛选出差异表达蛋白质.对差异表达的蛋白质进行基因本体(GO)分析、相互作用网络分析及通路分析.结果 在4组样品中共鉴定到5 158种蛋白质,与对照组相比,0.1 Gy组差异蛋白质有91种,0.5 Gy组有191种差异蛋白质,2.0 Gy组有68种差异蛋白质;3组共同差异表达的蛋白质有1 1种,其中,7种蛋白质表达上调,4种下调.对3个剂量组的差异表达蛋白质进行生物信息学分析显示,这些蛋白质主要与生物代谢及其调节过程、蛋白结合以及催化反应过程等有关,纤维黏连蛋白-1(FN1)和热休克蛋白1B(HSPA1B)是蛋白质相互作用网络的关键性节点.结论 不同剂量重离子照射诱导人淋巴细胞蛋白质组发生改变的机制不同,而且SZT2、FN1、HSPA1B蛋白质可能在重离子照射的损伤机制中发挥重要作用,有望成为重离子诱发辐射损伤的分子生物学标志.
关键词： 12C6+离子束 淋巴细胞 蛋白质组学 同位素标记的相对和绝对定量技术 -
137Cs γ射线累积照射大鼠后血清蛋白质组分析
目的 探讨137Csγ射线累积照射对SD大鼠血清蛋白质的影响.方法 将30只SD大鼠按随机数字表法分为3个剂量组:0.2 Gy累积照射组、2 Gy累积照射组和健康对照组.采用137Cs γ射线累积照射SD大鼠,剂量率为0.336 mGy/min.利用同位素标记的相对和绝对定量技术(iTRAQ)分析累积受照大鼠的血清蛋白质表达,筛选出差异蛋白质.对差异表达的蛋白质进行GO注释分析及相互作用网络分析.结果 在3组样品中共鉴定到363种蛋白;与健康对照组相比,0.2 Gy照射组差异蛋白质有50种,16种蛋白质上调,34种下调;2 Gy照射组有64种差异蛋白质,31种上调,33种下调;两组共同表达差异的蛋白质有29种,其中,10种蛋白表达上调,19种下调.根据细胞组成注释,多数蛋白为胞质蛋白、膜蛋白;根据分子功能注释,差异蛋白以蛋白质结合和酶活性调节等为主.两个剂量组共同差异表达的蛋白质构成相互作用网络.GSTP1、PGK1、P4HB、CAPZA1是蛋白质相互作用网络的关键性节点,这几个蛋白质直接或间接地与其他差异蛋白存在相互作用.结论 不同剂量累积照射可诱导大鼠血清蛋白质组的改变,GSTP1、PGK1、P4HB、CAPZA1蛋白可能在累积照射的损伤机制中发挥作用.
关键词： 累积照射 血清蛋白质组 同位素标记的相对和绝对定量技术 相互作用网络 -
热CO2气腹处理后结肠癌细胞株COLO2O5的蛋白组学变化
目的:研究热CO2气腹处理后结肠癌细胞株COLO 205的蛋白组学变化,为阐明热CO2气腹对结肠癌细胞的杀伤作用机制提供依据.方法:用热CO2气腹处理结肠癌细胞株COLO205,按有无处理分为处理组与对照组.分别抽提两组细胞的总蛋白质,采用同位素标记的相对和绝对定量(isobaric tags for relative absolute quantitation,iTRAQ)技术标记,液相色谱(LC)分离蛋白质,质谱仪(MS)进行蛋白质鉴定及Western blot检测.结果:共筛选得到18个差异表达的蛋白,其中8个蛋白表达上调,10个蛋白表达下调.Western blot显示热休克蛋白HSP70在细胞表达明显高于对照组(P＜0.01)；蛋白Myosin-9的表达量在处理后显著下降.结论:热CO2气腹处理后结肠癌细胞株COLO205的蛋白组学发生差异性变化.
关键词： 结肠癌 热 CO2气腹 同位素标记的相对和绝对定量技术 蛋白质组学
