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目标基因捕获测序技术鉴定肥厚型心肌病致病突变的研究
目的:利用目标基因靶向捕获高通量测序方法鉴定肥厚型心肌病(hypertrophic cardiomyopathy,HCM)致病突变,并进行基因型-临床表型的分析,以期对临床诊治提供参考依据.方法:连续收集10例HCM患者血液与临床资料.提取全血基因组DNA、文库制备,靶向富集8个编码肌小节蛋白的HCM的致病基因,并行高通量测序.结果:10例患者[平均年龄为(46±7.9)岁,女性占50％]中,4例患者发现5个基因突变位点.双突变(TNNT2 R286H和MYH7 R663H)携带者具有HCM家族史,发病早,左心室重度肥厚,心电图呈现传导阻滞.MYBPC3 D770N和MYBPC3 S236G突变携带者发病年龄晚,左心室肥厚程度较轻.MYH7 R869C突变携带者年龄大,左心室肥厚程度较重,心电图呈现明显左心室肥大证据.结论:对10例HCM患者利用目标基因捕获测序技术筛选出5个致病突变.携带不同突变的患者其临床表型不一致,这对患者的预后和治疗提供了有利的依据.
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高通量测序鉴定肥厚型心肌病患儿致病突变
目的 利用目标基因靶向捕获高通量测序方法鉴定肥厚型心肌病(HCM)患儿的致病突变,分析基因型与临床表型的关系.方法 对1例14岁男性HCM患儿进行血液与临床资料收集.提取其全血基因组DNA、文库制备,靶向富集8个编码肌小节蛋白的HCM的致病基因,并行高通量测序.通过生物信息学分析筛选致病突变.用1代测序来验证2代测序发现的致病突变位点.结果 患儿有晕厥史,左心室严重肥厚,心电图呈传导阻滞.目标基因捕获高通量测序筛查致病突变的结果经与公共数据库和内部健康人测序数据库对比,发现致病突变位点MYH7R869C.此位点检测结果与Sanger测序结果完全一致.结论 利用目标基因捕获测序技术可筛选出HCM致病突变MYH7 R869C.携带此突变的患儿临床表型严重.MYH7 R869C突变可能是我国HCM患儿的突变热点.
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外显子测序技术在疾病研究中的应用
新一代测序技术的发展为疾病研究带来了新的机遇.在现阶段,外显子测序与全基因组测序相比,不仅费用更低,数据的阐释也更为简单.通过对疾病样本进行外显子组捕获测序,不仅能快速发现罕见遗传疾病的致病基因,也能用于研究多基因引起的常见疾病,如癌症、糖尿病、高血压等,来揭示这些疾病的遗传致病机理.外显子测序技术是当前的热点技术,极大地推动了疾病研究的进展.
