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蛋白点匹配文献资料
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基于分层策略的凝胶图像间蛋白点匹配算法
凝胶图像间蛋白点比对分析是蛋白质组学研究的重要方法,针对凝胶图像间蛋白点人工比对工作量大和易出错等问题,提出一种基于分层策略的凝胶图像间蛋白点自动匹配算法.首先将每张凝胶图像中的蛋白点按不同灰度等级划分到对应层级中；然后根据蛋白点的灰度相关性,采用归一化互相关法对各层级蛋白点进行粗匹配；后以粗匹配蛋白点点对作为标记特征点,采用几何相关法和相似性准则,实现蛋白点间的精确匹配.通过对国际凝胶图和Bio-Rad公司测试图等不同图源的凝胶图像进行蛋白点匹配实验,结果表明,该算法具有较高的匹配精度,其匹配误差小于4％,对不同来源和不同图像形变的凝胶图像都具有较好的稳定性.
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基于相似度图的凝胶图像间蛋白点特征分析
针对现有凝胶图像间蛋白点匹配方法在选择特征时，没有直观和统一标准的问题，本文提出了基于相似度图的蛋白点特征分析方法。首先给出相似度图的定义和生成方法；其次利用相似度图法分析坐标相似度、形状上下文相似度和形态参数相似度等5种常用特征的特点及优劣；后根据特征分析结果提出一种多特征综合利用的乘积法，相比均值法具有更好的匹配效果。为验证相似度图和多特征综合乘积法的有效性，开展了多种图源的凝胶图像蛋白点匹配实验，结果表明，相似度图能够直观、有效地反映蛋白点特征的匹配性能，对多特征的选择和综合利用具有很好的指导意义。
