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Rv3841文献资料
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结核分枝杆菌BfrB蛋白的生物信息学分析
目的 应用生物信息学软件分析及预测结核分枝杆菌Rv3841基因编码蛋白BfrB的结构与功能. 方法 从NCBI数据库中获取Rv3841基因及其编码序列;利用ProtParam及ProtScale预测BfrB蛋白的理化性质及亲疏水性;应用SignalP 4.0及TMHMM分析BfrB蛋白的信号肽及跨膜区;应用SOPMA及SWISS MODEL 工具分析蛋白的二级结构,建立三级结构模型;利用Bepired1.0、ABCpred及SYFPEITHI、NetMHCIIpan预测蛋白的细胞表位,寻找佳B细胞与T细胞抗原表位. 结果 Rv3841编码的BfrB蛋白具有181个氨基酸残基,平均疏水系数为-0.277,为亲水性蛋白.BfrB蛋白无信号肽序列及跨膜区域,二级结构中α螺旋约占65.19％,β折叠6.63％,β折角4.97％,无规则卷曲23.2％.预测的B细胞、CTL细胞及Th细胞抗原表位分别为7、9、11个. 结论 生物信息学方法预测BfrB蛋白为亲水性蛋白,具有潜在的B、T细胞抗原表位,可作为研发新的结核病疫苗靶标.
