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亲肌肉蛋白文献资料
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细粒棘球绦虫myophilin的抗原表位预测
目的 应用生物信息学软件预测细粒棘球绦虫亲肌肉蛋白myophilin的二级结构及B、T细胞抗原表位,为其保护性抗原表位筛选提供依据. 方法 从Genbank中获取myophilin的氨基酸序列,采用SOPMA软件预测其二级结构;采用LEPS和ABCpred软件联合预测其B细胞抗原表位;采用IEDB和SYFPEITHI软件联合预测其T细胞抗原表位. 结果 α螺旋、β折叠、无规则卷曲和β转角在myophilin二级结构中所占的比例分别为47.89％、10.00％、30.53％和11.58％;潜在的B细胞抗原表位分别为19～27、41～48、92～101、110～118、128～137和155～162;潜在的T细胞抗原表位为9～18、140～148和157～165氨基酸序列. 结论 myophilin蛋白可能有6个B细胞抗原表位和3个T细胞抗原表位,有望用作免疫诊断抗原和疫苗候选抗原.
