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HPV16型文献资料
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HPV16型E6蛋白的B细胞线性表位预测及分析
目的 对高危型人乳头瘤病毒(Human papillomavirus) 16型E6蛋白的B细胞线性表位进行预测. 方法 以HPV16型E6蛋白(P03126)的全长氨基酸序列为基础,采用EXPASY网站上的生物信息学软件和DNAstar软件包中的Protean软件分析E6蛋白的二级结构,跨膜趋势及其亲水性,表面可及性,抗原性,极性和柔韧性等特性.综合以上参数预测HPV16型E6蛋白的B细胞线性表位,并进一步进行同源性匹配分析. 结果 综合多个参数分析显示B细胞线性表位可能位于E6蛋白N端2-7、9-19、30-36、45-49、105-109、119-125和148-158区段及其附近,进一步同源性匹配分析支持其中区段2-7、9-19、119-125及148-158为可能的B细胞线性表位,其中区段148-158(RSS-RTRRETQL)为HPV16型E6蛋白所特有的序列,而区段2-7 (HQKRTA)、9-19 (FQDPQERPRKL)与HPV9型E6蛋白具有同源性,区段119-125(PEEKQRH)与HPV31型E6蛋白具有同源性. 结论 综合分析预测HPV16型E6蛋白的B细胞线性表位可能位于E6蛋白N端2-7、9-19、119-125及148-158区段,为HPV16型E6蛋白的进一步研究奠定了基础.
