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辽宁省2008～2011年流行性腮腺炎野病毒SH蛋白基因特征分析
本研究用Vero/Slam细胞从辽宁省2008～2011年流行性腮腺炎暴发和散发患者的临床标本中分离到13株流行性腮腺炎野病毒(Mumps virus,MuV),应用逆转录聚合酶链反应(RT- PCR)针对MuV分离株的SH基因的316个核苷酸片段进行扩增,并对该产物进行序列测定.将这13株MuV与从GenBank下载的世界卫生组织(WHO)MuV基因型参考株一起进行分子流行病学研究.结果提示:除2011-015株外,辽宁省2008～2011年12株MuV分离株均属于F基因型,核苷酸和氨基酸同源性为94.9％～100％和83.3％～100％.与F基因型参考株序列相比,核苷酸和氨基酸同源性分别为92.4％～97.2％和96.5％～84.2％.表明2008～2011年辽宁省流行的F基因型MuV发生较大的型内变异.另外还发现F基因型MuV在SH基因上存在着特异性突变(CNt65,C Nt105,G Nt137,C Nt192,C Nt239,GNT262),而其它基因型MuV在这些位点上均未发生改变.F基因型MuV在SH基因编码的氨基酸保守位点也发生变化.如:第2位上由S→P,第6位上由P→L,第23位上由T→N,第48位上由L→P/R.与基因分型有关的氨基酸三联体,2008-01-007毒株也发生了改变,由IML变为TMP.2011-015株病毒与F基因型参考株平均核苷酸和氨基酸同源性分别为87.5％和79.8％,与G型参考株平均核苷酸和氨基酸同源性分别为96.8％和97.4％,属于G基因型.该基因型为中国内地首次发现.
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辽宁省流行性腮腺炎野病毒的分离与鉴定
本研究用Vero/Slam细胞首次从辽宁省2008年流行性腮腺炎暴发和散发患者的临床标本中分离到3株流行性腮腺炎野病毒(Mumps virus,MuV),应用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)针对MuV分离株的包括SH基因的1028个核苷酸片段进行PCR扩增,将扩增产物连接在pMD19-T载体后转化到大肠杆菌中进行克隆.通过蓝白斑筛选,将鉴定为阳性的白色菌落进行核苷酸序列测定分析.将这3株MuV结合从GenBank下载的世界卫生组织(WHO)MuV基因型参考株在基于WHO基因定型靶序列SH基因的316核甘酸片段构建基因亲缘关系树,一起进行分子流行病学研究.结果提示:辽宁省2008年3株MuV分离株的核苷酸和氨基酸同源性在98.7%～100%和94.7%～100%之间,其中LN-2008-001-06与LN-2008-001-10序列完全一致;与F基因型参考株序列相比,核苷酸和氨基酸同源性分别为92.4%～96.2%和84.2%～94.7%.提示辽宁省2008年3株流行性腮腺炎野病毒分离株均属F基因型.由于此次毒株数量太少,尚不能说明F基因型是否为辽宁省的优势基因型,需进一步扩大范围加强监测.
