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Aux/IAA家族基因文献资料
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地黄Aux/IAA家族基因RgIAA1的克隆和表达分析
为了克隆地黄Aux/IAA家族基因RgIAA1,分析地黄RgIAA1的时空表达特性及对逆境胁迫的响应.以拟南芥At IAA 14的cDNA序列为探针在地黄转录组数据库中进行比对,应用生物信息学方法分析RgIAA1的序列特征及进化关系,以实时荧光定量PCR技术检测Rg IAA1在地黄不同组织以及逆境胁迫下的表达量.结果表明,获得1条903 bp的cDNA序列,包含一个681 bp完整的开放阅读框(ORF),编码226个氨基酸,具有Aux/IAA家族蛋白的典型结构域和特征序列.RgIAA1在地黄不同组织中的表达呈差异表达,其中在地黄幼嫩叶片里表达强度大,其次为茎,且随着叶片的伸展,RgIAA1表达强度不断降低.在连作时RgIAA1的表达量升高,NaCl和渍水胁迫下RgIAA1的表达量降低.实验首次克隆了地黄Aux/IAA家族基因RgIAA1,为阐明其在地黄生长发育和逆境胁迫中的分子功能奠定基础.
关键词： 地黄 Aux/IAA家族基因 序列特征 表达分析
