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低密度基因芯片的性能与应用
[目的]研究低密度基因芯片的性能与应用.[方法]用SuperArray靶基因标记盒专一标记样品RNA与在芯片膜上靶基因相杂交.用PathwayFinder GEArray基因芯片膜对一个大肠癌症病人的癌组织和正常组织基因表达分别做了检测.用PC12细胞为实验系统,我们用Nicotine和Isoproterenol两个GPCR配体各自刺激PC12细胞,观察GPCR和G蛋白激活后,如何引起细胞内信号传导通道的开关,和这两个配体所引起细胞反应的区别.[结果]发现有4个基因HSF1、HSF27、HSF90和iNOS的表达在癌组织里有明显升高,PathwayFinder GEArray共含23个基因,它们各是8个不同重要信号传导通道的下游转录反应基因(downstream transcriptional response gene),也就是说一个信号传导通道的激活就会引起它下游转录反应基因表达的升高.对照相比,在Nicotine的刺激下Bcl21,Glu8,GRM5 and RPl13a基因表达有明显变化.在Isoproterenol的刺激下,Rpl13a,TF/F3,APM1,Bcl-x,FLJ10210,UCP1,RGS2,GALR2,EDG7,mGLU8,GRM5基因的表达有明显变化.[结论]低密度基因芯片具有充分的潜力成为将来临床检测的一个工具,用以检定特异诊断图谱.
关键词: 低密度基因芯片 聚焦芯片 基因特异性标识 Pathway Finder