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细菌人工染色体文库文献资料
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苦荞BAC文库的构建及BAC末端序列分析
目的:为了深入挖掘苦荞的基因组信息,筛选与苦荞品质相关的功能基因.方法:以苦荞品种“晋荞麦2号”为材料,参考Peterson等方法通过提取高分子量核DNA,经酶切、连接和转化构建苦养基因组BAC文库;随机挑选48个BAC克隆进行序列末端测序.结果:该文库包括30000个克隆,插入片段平均大小约为123kb,空载率小于1%,覆盖苦荞基因组6.9倍.共得到89条BAC末端序列,通过序列比对分析发现,7条(8%)有比对结果.其中,有末端序列与rpoTm2、Trrap、MDR1等已知基因相似,这些基因与DNA锚定,物质跨膜运输和磷酸转移酶活性等功能有关.分析还发现末端序列40G19-F可能是苦荞基因组的重复序列.结论:苦荞BAC文库构建为今后苦荞基因的克隆及全基因组测序奠定了基础.