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跨膜丝氨酸蛋白酶2-红细胞转化特异性转录因子相关基因文献资料
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红细胞转化特异性转录因子相关基因的生物信息学研究
目的 利用生物信息学方法分析人红细胞转化特异性转录因子(ETS)相关基因(ERG)以及蛋白的结构,为进一步研究其功能和参与的调控机制提供理论依据.方法 通过GenBank搜索ERG基因序列(NM_ 001136154)及蛋白序列(NP_001230357),采用生物信息学方法分析该基因在不同物种中的差异,分析该蛋白的亚细胞定位、二级结构、功能域以及相互作用蛋白.结果 该基因编码一个长度为468个氨基酸的蛋白质,具有2个PNT和ETS两个功能域.ERG蛋白理论相对分子质量为53 837.51,理论等电点为7.29.二级结构中α螺旋(H)占比12.35％,β折叠(E)占比3.50％,无规卷曲占比84.16％.ERG蛋白含有4个可能的N连接糖基化位点,11个潜在的酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点,5个豆蔻酰基化位点,7个蛋白激酶C(PKC)磷酸化位点以及1个酪氨酸激酶磷酸化位点.并进一步利用STRING分析了该蛋白的相互作用网络.结论 利用生物信息学预测出的结构和功能信息,为ERG的相关研究提供一定的信息基础.
