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基因/病毒文献资料
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庚型肝炎病毒E区部分基因克隆及序列分析
目的建立适合我国国情的HGV诊断方法及进一步研制预防HG的疫苗.方法通过逆转录-套式-聚合酶链反应,从1例输血后丙肝患者血清中扩增出768 bp的庚型肝炎病毒cDNA序列,反应产物克隆进M13mp18噬菌体,阳性克隆抽提单链以双脱氧终止法双向测定其序列.结果所分离的HGV E区768 bp的核苷酸与国内外已发表的4株HGV序列比较,同源性分别为:U44402 81.5%,U45966 82.8%,U36380 84.5%,U75356 95.8%;根据所测得的cDNA序列推导出其编码的氨基酸序列,在氨基酸水平上较4株HGV序列同源性分别为:U44402 87.7%,U45966 91.5%,U36380 94.1%,U75356 95.8%.结论证实国内存在丙型肝炎与庚型肝炎病毒合并感染;此序列与中国株HGV同源性较高,与美国株HGV及西非株(GBV-C)同源性相对较低;推导出的氨基酸水平的同源性高于核苷酸水平;HGV E区较非结构区NS3、NS5及5＇非编码区(5＇UTR)的变异为大.
