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dN/dS文献资料
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丙型肝炎病毒亚型的E1、E2变异性分析
目的 了解丙型肝炎(丙肝)病毒几种亚型(1a、1b、2a、2b、3a、4a、5a和6a)包膜基因的变异性.方法 应用相应的软件分析丙肝病毒包膜蛋白(E1、E2)的核苷酸和氨基酸序列,计算这些包膜基因的非同义突变与同义突变的比值(dN/dS),并预测E1和E2的糖基化位点.结果 我们发现在丙肝病毒1b亚型内,E1与E2相比变异性更大、dN/dS值更大、糖基化位点更多.结论 E1蛋白可能在HCV免疫机制中起到重要作用,尤其是在1b亚型内,E1内基因更大的变异性、更高的dN/dS值和更多的糖基化位点数足以证实这点;将在未来有关丙肝病毒药物抵抗性和免疫机制的研究中应将E1区域纳为一个重要因素.
