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UDP-糖基转移酶文献资料
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三七PnUGT1基因的全长cDNA克隆和生物信息学分析
本研究通过对三七的转录组高通量测序结果进行分析,采用5'-RACE和RT-PCR方法,对其中一条可能参与三萜皂苷合成的UDP-糖基转移酶基因转录本(Pn02086)进行全长克隆,预测了该基因编码蛋白的理化性质、保守结构域等,并对其进行了进化分析.通过全长克隆,得到一条开放阅读框为1488 bp的cDNA序列,命名为PnUGT1,GenBank登录号JX018210.该基因编码495个氨基酸,蛋白分子量为55.453kD,属于不稳定蛋白.二级结构中α-螺旋占36.16％、β-折叠占11.31％、无规卷曲占52.53％.InterProScan预测该蛋白具有7个保守结构域,包括在植物次生代谢产物中相关糖基转移酶特有的PSPG保守基序.该蛋白不具有信号肽和跨膜区,有可能定位在细胞质中.序列比对和进化关系分析表明,该蛋白和蒺藜苜蓿三萜合成相关的UDP-糖基转移酶AAW56092的亲缘关系较近,PSPG保守区域的相似性为66％.该基因在三七叶中表达量较在花、茎和根中的表达量高.推测PnUGT1基因可能参与了三七皂苷的合成.
