您当前的位置：
首页 > 文献资料
所属专业：
Qlucore Omics Explorer软件文献资料
-
丙型肝炎病毒相关性肝细胞癌的基因表达分析
目的 分析慢性丙型肝炎发展为肝细胞癌(HCC)过程中的差异表达基因谱.方法 以GEO数据库的基因表达谱数据GDS4880、GDS4887为分析材料,采用Qlucore Omics Explorer 3.0软件筛选慢性丙型肝炎与丙型肝炎病毒(HCV)相关性肝细胞癌芯片数据的差异表达基因,结合生物信息学工具PANTHER、DAVID、STRING、Cytoscape对差异表达基因及其相互作用关系进行分析.结果 筛选出共差异表达基因328个,其中上调表达133个,下调表达195个.这些差异表达基因主要涉及代谢过程、生物调节、定位等生物过程,p53信号通路、胰岛素信号通路、磷脂酰肌醇信号系统、细胞凋亡等信号通路.差异表达基因编码蛋白间的相互作用主要集中在14个蛋白质(CYP2B6、CYP2E1、AKT1、CDK16、RELA、CDC27、PIK3CA、GNB1、FOXO1、FYN、PDPK1、SCAND1、SGOL1、RPH3AL).结论 CYP2E1等14个基因可能与HCV相关性肝细胞癌的发生发展相关.
