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发热伴血小板减少综合征病毒感染者血清microRNA表达谱分析
目的 了解发热伴血小板减少综合征病毒(severe fever with thrombocytopenia syndrome virus,SFTSV)感染急性期患者血清microRNAs (miRNAs)的表达谱,鉴定与病毒感染或宿主免疫应答相关miRNAs.方法 采用TaqMan低密度芯片获得血清miRNA的表达谱,分析患者与正常人miR-NA的表达差异,鉴定与病毒感染或免疫相关的miRNA,后用实时定量RT-PCR对部分miRNA进行验证.结果 TLDA芯片结果显示,与正常人血清相比,SFTS血清表达上调超过2倍的miRNA有117个,表达下调超过2倍的miRNA有30个.在表达差异较为明显的miRNA中,病毒感染或免疫相关miRNA有23个.对6个miRNA的表达进行定量RT-PCR验证,其中miR-155,miR-126,miR-15b,miR-19b与芯片结果一致.结论 通过TaqMan低密度芯片获得了SFTS病毒感染者血清miRNA的表达谱,其中部分miRNA与病毒感染或免疫相关.
关键词： 发热伴血小板减少综合征病毒 血清 microRNAs 低密度芯片 -
高通量实时荧光定量RT-PCR方法验证FL细胞对苯并(a)芘7,8-二氢二醇9,10-环氧化物处理的差异表达基因
目的 验证由寡核苷酸微阵列检出的FL细胞对苯并(a)芘7,8-二氢二醇9,10-环氧化物(BPDE)处理的差异表达基因.方法 FL细胞分别经0.1%二甲亚砜(DMSO)和0.5 μmol·L-1 BPDE处理,以高通量实时荧光定量RT-PCR方法(TaqMan低密度芯片)平行检测185个目标基因的相对表达水平.结果 BPDE处理组相对DMSO对照组,51个基因表达有差异,12个基因表达上调,39个基因表达下调,(n=3,P＜0.05),涉及细胞增殖,分化,凋亡调控基因,转录调节基因和代谢酶基因等.结论 高通量实时荧光定量RT-PCR可迅速对微阵列数据进行验证,差异表达谱有助于研究BPDE的毒理机制和细胞的应答反应.
