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同源异形盒基因A1文献资料
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HOXA1基因在口腔鳞状细胞癌组织中的表达及临床意义
目的:探讨同源异形盒基因A1(HOXA1)基因在口腔鳞状细胞癌(oral squamous cell carcinoma,OSCC)患者组织中的表达情况与临床特征及预后相关性.方法:从NCBI(美国国立生物技术信息中心)的GEO数据库下载OSCC相关芯片数据(GSE42743),包含74例OSCC样本及29例正常口腔黏膜样本,分析HOXA1基因在二者之间的表达情况;收集73例OSCC组织的基因表达谱及相关临床数据,对样本中的HOXA1基因表达数据及其对应的临床信息进行相关性分析,生存分析HOXA1基因与OSCC总生存期及特异性生存期的相关性;采用基因集富集分析方法探讨HOXA1基因在OSCC中可能的作用机制.结果:OSCC组织中HOXA1基因表达水平明显高于正常黏膜组织(P<0.05);73例OSCC样本中,HOXA1基因表达水平与T分期、CN分期、AJCC分期显著相关(P<0.05);生存分析示HOXA1高表达患者预后明显差于HOXA1低表达组(P<0.05);基因富集分析提示,HOXA1基因高表达样本主要富集了E2F、MYC、mTORC1信号通路及G2M检查点、有丝分裂、蛋白分泌功能基因集,影响OSCC的生物学过程.结论:HOXA1基因高表达与OSCC患者的进展相关,可作为其独立预后危险因素.
