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基于生物信息学的未分化甲状腺癌关键发病机制及其潜在干预靶点研究
目的:阐明未分化型甲状腺癌(ATC)的分子病理状态,并挖掘其潜在的干预策略.方法:利用GEO数据库联合R语言分析ATC组织与正常甲状腺组织差异表达的基因;利用京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路数据库和基因本体(GO)数据库对差异表达的基因进行富集和功能注释;基于STRING数据库及Cytoscape软件构建蛋白质相互作用网络,分析其关键网络节点和基因簇;后采用L1000CDS2数据库预测ATC的潜在治疗药物.结果:共获得2087个差异表达基因.与正常甲状腺组织相比,ATC组织细胞内信号通路及肿瘤微环境均发生显著改变,包括PI3 K-Akt信号的持续激活、p53通路的激活、炎症反应、细胞外基质重塑等.蛋白质相互作用网络提示存在3个重要的基因簇和9个关键节点.将差异表达基因与L1000CDS2数据库进行比对后发现22个能够逆转ATC病理状态的潜在化合物.结论:本研究揭示了ATC发病机制中的关键节点,为ATC的治疗提供了潜在的靶点.
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uPA、β-catenin表达及MVD与甲状腺癌侵袭转移的关系
目的 研究甲状腺癌组织中尿激酶型纤溶酶原激活物(uPA)、β-连环素蛋白(β-catenin)表达及其与血管生成的关系,探讨其在甲状腺癌侵袭、转移中的作用.方法 采用免疫组织化学SP法检测90例人甲状腺癌组织中uPA、β-catenin及CD105的表达,并对CD105表达阳性血管进行微血管密度(MVD)计数,结合甲状腺癌的临床病理特征进行分析.结果 甲状腺癌组织中uPA阳隆表达、β-catenin异常表达及MVD值与甲状腺癌组织分型有关,在淋巴结有无转移间以及病理分期Ⅰ～Ⅱ期、Ⅲ～Ⅳ期之间差异有统计学意义(P<0.05).甲状腺癌组织的MVD值与uPA阳性表达、β-catenin异常表达呈正相关(r=0.766,P<0.05);uPA阳性表达与β-catenin异常表达呈正相关(r=0.922,P<0.05).结论 甲状腺癌uPA阳性表达率高,广泛存在β-catenin膜表达率降低及胞质和(或)胞核内异常表达,且与其组织类型、临床分期及侵袭转移密切相关.MVD计数与甲状腺癌组织类型、临床分期及侵袭转移密切相关.uPA、β-catenin在甲状腺癌肿瘤血管生成中具有协同作用.uPA、β-catenin及MVD可作为甲状腺癌患者顸后判断的指标.
