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蛋白-蛋白对接文献资料
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CDC25B与CDK2/Cyclin A蛋白相互作用研究
目的:研究双特异性蛋白磷酸酶B(CDC25B)与细胞周期素A(CyclinA)和细胞周期素依赖性激酶2(CDK2)蛋白发生相互作用的结构基础.方法:应用Discovery Studio (DS) v3.5中的ZDOCK模块对CDC25B与CDK2/CyclinA蛋白进行对接.应用“Analyze Protein Interface”模块计算CDC25B蛋白和CDK2/Cyclin A蛋白的溶剂可及表面积(SAS)并分析CDC25B蛋白和CDK2/Cyclin A蛋白相互作用界面的关键氨基酸残基.应用“Calculate Interaction Energy”模块计算CDC25B蛋白和CDK2/CyclinA蛋白相互作用界面处的关键氨基酸残基间的相互作用能.结果:对pose 1的疏水相互作用、氢键相互作用、相互作用能进行计算分析,预测得到CDC25B-CDK2/Cyclin A复合物的结合模式及起相互作用的氨基酸残基(CDC25B:GLY380,TYR382,ARG485,ARG488,GLU489,ARG490,ARG492,TYR497;CDK2/Cyclin A:THR165,TRP167,ASP206,SER207,ASP210,PHE213).结论:该结果为今后深入研究CDC25B通路和发挥协同刺激作用的信号体系以及基于该信号途径新型分子靶向药物的设计提供了理论基础.
关键词： CDC25B CDK2/Cyclin A 蛋白-蛋白对接 关键氨基酸
