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KRAB/C2H2文献资料
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在心脏组织表达的一个人类新基因
KRAB/C2H2型锌指蛋白是一类具有重要功能的转录调节因子.初步克隆了一个新的人类 KRAB/C2H2型锌指蛋白基因,经国际基因命名委员会批准命名为 ZNF569.此基因在基因组DNA上长约56.28 kb.定位于19q13.12.ORF全长2061个碱基,含6个外显子,5个内含子,编码一个长686个氨基酸残基的蛋白质.该蛋白包含一个KRAB结构域和18个锌指结构域.Northern 杂交结果表明,ZNF382 mRNA在早期胚胎时期就开始表达,在不同时期人类胚胎组织中广泛表达,包括脑,心脏,肝和骨骼肌.在成人组织中重点表达在心脏,在肝,胰和骨骼肌中也有表达,其结构和表达特征预示着 ZNF569在心脏发育和功能的发挥起着潜在的作用.
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人类心脏发育候选基因ZNF569的生物信息学分析
目的 分析人类心脏发育候选基因ZNF569的生物信息学,对其功能研究提供指导意见.方法 利用生物信息学网站及生物软件对人类心脏发育候选基因ZNF569进行生物信息学分析.结果 ZNF569是一个新的人类KRAB/C2H2型锌指蛋白基因.此基因在基因组DNA上长约56.28 kb,定位于19q13.12.开放阅读框全长2061个碱基,含6个外显子,5个内含子,编码一个长686个氨基酸残基的蛋白质.该蛋白包含一个KRAB结构域和18个锌指结构域,进化分析表明各种真核生物中都存在ZNF569的同源蛋白,而ZNF569蛋白与鼠ZNF74蛋白的相似度达到94%,它们之间的蛋白质序列保守度更高.ZNF569本身18个锌指结构蛋白质序列也高度保守.结论 ZNF569及其同源蛋白构成了一个在进化中高度保守的新的KRAB-ZF基因,而它的功能尚未见报道.
