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北京地区实验动物中嗜肺巴斯德杆菌的表型分析
目的：对北京地区实验动物中的嗜肺巴斯德杆菌分离株进行表型分析，提高检测的准确性。方法通过生化鉴定和16S rDNA测序，对306株嗜肺巴斯德杆菌可疑菌株进行鉴定。结合分离株在血琼脂平皿上的菌落特征和生化特性，组成53个特征数据谱，进行表型特征的聚类分析。结果306株分离株中，BD 自动细菌鉴定系统和16S rDNA 测序鉴定出嗜肺巴斯德杆菌的阳性率分别为164／306和227／306。227株嗜肺巴斯德杆菌真阳性的表型特征共有140种，Heyl 型106种，Jawetz 型23种。结论北京地区实验动物中嗜肺巴斯德杆菌主要为Heyl 型感染，Jawetz 型较少，表型特征多样，分布广泛。
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梗阻性黄疸患者胆汁微生物群落限制性片段多态性分析
目的 探讨梗阻性黄疸患者胆汁中的微生物群落结构.方法 应用末端标记限制性片段长度多态性(T-RFLP)和克隆文库分析,对昆明医科大学第二附属医院肝胆胰外科三病区2010年10月至2013年10月期间诊断为梗阻性黄疸患者的胆汁进行细菌培养,培养结果为阴性的患者胆汁再进行微生物群落结构进行分析.结果 共117例患者的胆汁纳入研究,胆汁中细菌16S核糖体DNA (rDNA)阳性率为42.7％ (50/117).不同梗阻原因胆汁中细菌16S rDNA阳性率(97.3％比17.5％)差异有统计学意义(P＜0.05),而梗阻位置相同的细菌16S rDNA阳性率(43.3％比38.1％)差异无统计学意义(P＞0.05).结论 采用T-RFLP方法分析16S rDNA克隆片段能够有效评估梗阻性黄疸患者胆汁中的细菌群落存在和多样性.
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16S核糖体DNA Amplicon测序法分析2型糖尿病患者口腔微生物多样性
目的 探讨2型糖尿病患者口腔微生物多样性及结构的差异.方法 采集23例2型糖尿病患者与23名正常人的唾液与龈上菌斑样本,提取口腔菌群的总DNA,利用16S核糖体DNA(16S ribosome DNA,16SrDNA)Amplicon测序法进行测序,使用Pandaseq、Qiime等软件分析菌群多样性及结构.结果 2型糖尿病患者和正常人口腔菌群丰度及优势菌属差异无统计学意义(P>0.05).2型糖尿病患者样本中布雷德菌属、瘤胃菌科、幽门螺杆菌科丰度较高,正常人样本中韦荣菌科、Selenomonadales目、Negativicutes纲、月形单胞菌属、丁酸弧菌属、Anaeroglobus属、Candidatus-Saccharibacteria门、Saccharibacteria genera incertae sedis属、诺卡菌科、气微菌属丰度较高,差异有统计学意义(P<0.05).结论 用16SrDNA Amplicon测序法分析2型糖尿病患者与正常人口腔菌群结构具有相似性,幽门螺杆菌与2型糖尿病之间的关系还有待于进一步的研究.
