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iTRAQ标记定量蛋白组学文献资料
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激光捕获显微切割技术结合iTRAQ标记定量蛋白质组在结肠癌筛查中的应用研究
目的 采用激光捕获显微切割技术(LCM)结合iTRAQ标记定量蛋白质组技术,筛查结肠癌间质的差异表达蛋白质.方法 ①选择12对结肠腺癌标本为观察组,其配对正常结肠黏膜(与结肠癌标本至少相距10 cm以上)为对照组,采用LCM技术分别纯化其间质作为生物样本;②iTRAQ标记定量蛋白质组技术鉴定两组间的差异表达蛋白质;③采用Geneontology生物信息学软件(http://pantherdb.org/)对差异表达蛋白质进行细胞成分、生物学途径和分子功能分析.结果 ①鉴定了70个差异表达蛋白,其中37个蛋白在结肠癌间质中高表达,33个蛋白在结肠癌间质中表达降低;②从生物学途径、细胞成分、分子功能三个方面对差异表达蛋白质进行分析.结论 ①首次采用iTRAQ标记定量蛋白质组学和LCM结合的方法筛查结肠癌间质差异表达蛋白质;②GO功能分析显示了差异表达蛋白质的细胞成分、分子功能以及生物学功能.
关键词： 结肠癌 间质 激光捕获显微切割 iTRAQ标记定量蛋白组学 生物信息学
