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  • 2D-PCA在基因特征提取中的应用

    作者:李时辉;楼天良

    目的 研究一种高效的基因特征提取方法,以尽可能地克服传统噪声基因剔除法中阈值设置主观性带来的信息丢失问题.方法 收集Golub等发布的急性白血病基因表达谱公共数据库中的数据.相对宽松地剔除噪声基因,适当增加被选基因数量,进而利用二维主元分析法(2D-PCA)技术进行二次基因特征提取,并采用基于机器支持向量机(SVM)的分类形式.结果 文中方法可获得90个二次特征和100.00%的分类精度;与直接利用一次特征进行分类相比,分类精度可提高2.78 ~ 8.35%.结论 通过适当增加被选基因数量提取高效且维数相对较低的特征是可行的.

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