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Bruker MS与VITEK-MS鉴定近平滑念珠菌复合体的性能对比
目的 评估中国医院侵袭性真菌监测网(CHIF-NET) 10和11收集的近平滑念珠菌复合体原始鉴定、Bruker MS与VITEK MS鉴定结果.方法 经中心实验室分子生物学方法复核鉴定确认,CHIF-NET 10和11从全国22所医院共收集到近平滑念珠菌复合体352株,包括近平滑念珠菌305株,似平滑念珠菌36株,拟平滑念珠菌11株;以复核鉴定结果为金标准,评价各单位原始常规方法鉴定结果,并评估Bruker MS和VITEK MS基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)对近平滑念珠菌复合体的鉴定性能.结果 与分子生物学鉴定结果相比,近平滑念珠菌的各医院原始鉴定准确率为90.8％,9.2％的菌株被API 20C或VITEK-2错误鉴定为光滑念珠菌、季也蒙念珠菌等;常规方法无法鉴定似平滑念珠菌和拟平滑念珠菌;Bruker MS和VITEK MS对305株近平滑念珠菌鉴定准确率分别达到了98.4％和97.7％;Bruker Biotyper 3.0数据库中有似平滑念珠菌和拟平滑念珠菌参考图谱,但鉴定准确率仅分别为33.3％和27.3％;VITEK MS V2.0没有两种菌的参考图谱而无法鉴定.结论 该项研究率先在国内评估了BrukerMS和VITEK MS鉴定近平滑念珠菌复合体的性能,证明二者对于近平滑念珠菌的鉴定是比较可靠的.
关键词： 近平滑念珠菌复合体 鉴定 ITS测序 基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱 -
眼部致病性不产孢子菌的ITS测序研究
目的:运用真核生物核糖体RNA基因(rDNA)内部转录间隔区(internal transcribed spacer,ITS)测序技术对不产孢子菌进行菌属鉴定,揭示海南岛眼部致病性不产孢子菌的生物多样性.方法:选取海南眼科医院检验科分离培养并镜检确定为不产孢子菌的真菌菌株19株,所有菌株均分离自感染性眼病患者眼部感染组织,接种于土豆葡萄糖琼脂培养基和沙氏培养基37℃温箱孵育7～21 d后,镜检未发现生殖结构.采用玻璃研磨器研磨联合化学法提取真菌DNA,PCR扩增核糖体ITS保守序列,通过GenBank基因数据库对扩增出的ITS序列进行比对分析,确定致病菌种属.结果:经PCR扩增后19株样本菌均得到清晰的目的条带.基因测序比对结果显示,19株不产孢子菌分属12个种属,包括可可毛色二孢子菌6株,月状弯孢霉1株,节菱孢霉菌2株,neodeightonia subglabosa 2株,红贝菌1株,肉座菌1株,多喙茎点霉1株,红色毛藓菌1株,深海曲霉菌1株,roussoella siamensis 1株,撕裂蜡孔菌1株、茄病镰刀菌1株.结论:ITS基因测序技术可较准确地鉴定不产孢子菌的种属,是对传统真菌鉴定方法的有益补充.我国海南岛这一热带地区致病性不产孢子菌种属多样,且与多种感染性眼病的发生相关.
