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生物通路差异筛选文献资料
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SACNet:一种癌症网络合成与分析系统
目的 针对目前癌症的疾病网络构造的片面性和不精确性,提出一个基于集成多种数据源的癌症网络构造分析辅助工具系统.方法 基于KEGG数据库的癌症生物通路和DisGeNET数据库的基因疾病关系等数据源,利用生物通路差异分析方法结合癌症基因表达数据获取差异通路集合,集成网络可视化工具生成癌症网络,结合网络聚类分析方法给出聚类分析结果 ,并对聚类分析结果进行基因功能聚类,分析癌症聚类子网络在癌症中的生物学功能.结果该工具系统生成的癌症网络以及聚类得到的网络分析结果能较准确反映出癌症和致病基因之间的联系.结论 该系统界面友好,人机交互性好,可以有效辅助科研人员工作,对探寻癌症内部致病机制具有价值和意义.
