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rpoβ基因芯片文献资料
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基因芯片技术检测结核分支杆菌耐利福平基因突变的研究
目的 建立基因芯片检测结核分支杆菌耐利福平基因突变,结合基因测序和常规药物敏感性试验进行比较,探讨其实用价值.方法 根据结核菌rpoβ基因突变特点.设计不同的寡核苷酸探针,点样制备可检测rpoβ基因突变的芯片,检测利福平(Rifompicin,RFP)株的rpoβ变异情况.结果 137株临床分离结核菌,49株耐RFP,占35.8%,平均MIC为179.6±135.0 μg/mL.Rpoβ突变率为95.7%(47/49),主要为点突变.突变点依次为531 Ser(TCG)→Leu(TTG)(40.8%)、531 Ser (TCG)→Trp(TGG)(12.2%)、526His(CAC)→Tyr(TAC)(6.1%)、526His(CAC)→Asp(GAC)(6.1%)、526His(CAC)→Asn(AAC)(6.1%)、526His(CAC)→Pro(CCC)(8.2%)、516Asp(GAC)→Val(GTC)(12.2%)、533Leu(CTG)→Arg(CGG)(4.1%)和513GIn(CAA)→Pro(CCA)(2.1%).结论 本研究建立的检测结核菌rpoβ基因突变的基因芯片技术敏感性高,特异性强,可应用于结核菌耐RFP基因的检测.
