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长链非编码RNA基因芯片文献资料
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HOX基因在喉癌组织与癌旁正常组织中的表达谱研究
目的 应用长链非编码RNA基因芯片研究HOX 基因在喉癌组织与癌旁正常组织中的表达谱.方法 设立5组经过严格配对的实验组(人喉癌组织)与对照组(同一患者癌旁正常组织).手术中切取人喉癌组织及癌旁正常组织,应用Triozl法抽提所取标本总RNA,纯化RNA后,将等量的两组RNA样本逆转录为荧光标记的cRNA混合物,与长链非编码RNA基因芯片进行杂交.应用Agilent扫描仪对芯片荧光信号图像进行扫描,及对原始数据进行计算机统计学分析,结果得到实验组与对照组两种组织之间HOX基因的LncRNA和mRNA的差异表达谱.结果 在LncRNA表达谱的统计结果中,筛选出差异表达HOX基因簇的LncRNA有18条,表达上调的有8条,表达下调的有10条.在mRNA表达谱的统计结果中,筛选出差异表达的HOX基因簇的mRNA有17条,表达上调的有15条,表达下调的有2条.结论 与癌旁正常组织相比,HOX基因在喉癌组织中的表达谱发生了显著变化.
关键词： 长链非编码RNA基因芯片 HOX基因 喉癌
