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Illumina Hiseq 2500文献资料
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基于高通量测序的青叶胆转录组研究
目的 探讨青叶胆中獐牙菜苦苷生物合成的遗传基础.方法 采用Illumina Hiseq 2500高通量测序技术,对青叶胆全草进行转录组测序.结果 共获得68 643个unigene,平均长度901 bp,共有42 954条unigene注释到NR,SwissProt,COG,KOG,GO,Pfam数据库中,獐牙菜苦苷生物合成的3个阶段中,有43条unigene参与中间体的生成,3条unigene参与萜类骨架合成,25条unigene可能参与萜类后的修饰.结论 首次对青叶胆转录组进行测序分析,获得了可能参与獐牙菜苦苷生物合成的候选基因,为后续功能基因的挖掘奠定了基础.
关键词： 青叶胆 转录组 Illumina Hiseq 2500 獐牙菜苦苷
