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结直肠癌特征性环状RNA筛选
目的:检测环状RNA (circularRNA,circRNA)在结直肠癌组织及对应癌旁组织中的表达谱变化.方法:应用高通量circRNA芯片技术筛选6例人结直肠癌组织及对应癌旁组织中circRNA表达谱差异,经过对原始数据进行预处理、归一化后,筛选出差异表达的circRNA,并对其进行聚类分析.结果:结直肠癌组织与癌旁组织之间存在892种circRNA的差异表达,其中在肿瘤组织中高表达的有412条,低表达的有480条(变化＞2倍且P＜ 0.05).结论:结直肠癌组织与对应癌旁组织比较,circRNA表达谱发生了显著变化,提示这些差异表达的circRNA可能与结直肠癌的发生发展密切相关.
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人鼻咽癌组织环状RNA差异表达分析
目的 环状RNA(circRNA)在肿瘤发生发展中发挥重要作用,但其与鼻咽癌的关系鲜有报道.文中旨在检测circRNA在人鼻咽癌组织及慢性鼻咽黏膜炎组织的表达谱差异. 方法 应用高通量circRNA芯片技术,采集2016年11月至2017年3月在广东医科大学附属医院进行活检的鼻咽癌组织和鼻咽慢性黏膜炎组织标本各3份,分析circRNA表达谱差异.通过对原始数据进行预处理、归一化,筛选出差异表达的circRNA,并对其进行聚类分析,Gene Ontology (GO)分析及KEGG Pathway分析,分析差异circRNA的功能分类及相关通路. 结果 鼻咽癌组织与慢性鼻咽黏膜炎组织之间共筛选出差异表达circRNA 829个,其中鼻咽癌组织中表达上调者761个,下调者68个.差异表达circRNA主要与细胞周期、细胞增殖等生物学进程有关;主要参与p53信号通路,细胞周期信号通路和DNA复制信号通路等. 结论 差异表达的circRNA与鼻咽癌的发生发展密切相关.
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小鼠牙乳头细胞向成牙本质细胞向分化过程中环状RNA的表达谱研究
目的:探讨环状RNA(circle RNA,circRNA)在小鼠牙乳头细胞向成牙本质细胞向分化前后的表达差异,研究circRNA在成牙本质细胞发育过程中发挥的作用.方法:利用circRNA芯片技术检测矿化诱导组与未矿化组原代小鼠牙乳头细胞的circRNA表达谱,经过对原始数据进行预处理,均一化后,找出差异表达的circRNA.根据表达差异倍数较高和样本间一致性较好的原则筛选circRNA.结果:与未矿化组相比,矿化诱导组小鼠牙乳头细胞中2倍以上表达,并且差异具有统计学意义(P≤0.01)的circRNA定义为差异表达的circRNA.在经矿化诱导的牙乳头细胞中,差异表达circRNA共4064条,其中上调表达3255条,下调表达809条.结论:circRNA芯片可用于筛选牙乳头细胞向成牙本质细胞分化过程中差异表达的circRNA,在小鼠牙乳头细胞向成牙本质细胞向分化过程中,circRNA表达谱发生了显著变化,说明circRNA在成牙本质细胞发育过程中发挥着重要的调控作用.
