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肠炎和肠炎相关结直肠癌miRNA表达检测及生物信息学分析
背景与目的：炎症性肠病(inflammatory bowel diseases，IBD)为一组慢性肠道疾病，包括溃疡性结肠炎(ulcerative colitis，UC)与克罗恩病(Crohn’s disease，CD)。肠炎相关性结直肠癌(colitis-associated col-orectal cancers，CAC)是由IBD癌化形成的一种恶性肿瘤。该研究通过检测UC、CD和CAC组织中相关微小核糖核酸(miRNA)的水平，初步探讨其作为肠炎癌转化分子标志物的可能性，并对在肠炎和CAC中显著变化的一组miRNAs进行靶基因归集和生物信息学分析，为以miRNAs为靶点的基因治疗提供理论和实验基础。方法：采用实时荧光定量聚合酶链反应(real-time lfuorescent quantitative polymerase chain reaction，RTFQ-PCR)技术，检测13例UC组织、3例CD患者组织、12例CAC组织及8例正常肠组织中16种miRNAs的表达。通过生物信息学对显著变化的一组miRNA进行靶基因分析，将文献中已报导的所有靶基因进行汇总，并利用DAVID数据库对靶基因进行功能富集分析(GO-analysis)和信号转导通路富集分析(KEGG-analysis，BIOCARTA-analysis)。结果：炎症相关miR-146a和癌症相关miR-27a、miR-29a、miR-20a、miR-21在UC、CD和CAC中的表达都显著高于正常结肠组织，且这一组miRNA的靶基因都富集在癌症相关通路、免疫信号相关通路和炎癌转换相关通路上。结论：miR-146a、miR-27a、miR-29a、miR-20a和miR-21可能是参与肠炎向结直肠癌转化的一组miRNA。
