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一条人类砷相关新cDNA基因的克隆及功能预测
目的探讨砷化物与基因的相互作用,克隆砷相关基因,利用生物信息学分析克隆基因.方法利用SMART方法构建cDNA文库,杂交筛选并克隆基因,生物信息学对克隆基因进行结构和功能的分析.6 μmol/L NaAsO2处理人正常肝L-02细胞2 h,抽提RNA做基因芯片杂交.结果成功克隆一条新cDNA基因,生物信息学分析发现7到456有一个完整的ORF,在编码起始区有典型的Kozak序列,编码149个氨基酸的蛋白质.核酸同源性比对发现与人类1p36.2-36.3染色体DNA序列同源性达98%,编码蛋白质同Alu亚家族SB序列同源性达85%.染砷细胞基因芯片杂交发现克隆基因表达增高.结论克隆了人类砷相关基因,该基因编码蛋白质与Alu亚家族SB序列同源性高.
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一条人类砷相关新cDNA基因的克隆及生物信息学分析
目的: 探讨砷化物与基因的相互作用,克隆砷相关基因,利用生物信息学技术分析克隆基因.方法: 采用SMART方法构建cDNA文库,杂交筛选并克隆基因,利用生物信息学手段对克隆基因进行结构和功能的分析.6 μmol/L NaAsO2 处理人正常肝L-02细胞2 h,抽提RNA做基因芯片杂交.结果:成功克隆一条新基因,生物信息学分析发现在7到456碱基范围内有一个完整的ORF,在编码起始区有典型的Kozak序列,编码149个氨基酸的蛋白质.核酸同源性比对发现与人类1p36.2-36.3染色体DNA序列同源性达98%,编码蛋白质同Alu 亚家族 SB序列同源性达85%.染砷细胞基因芯片杂交发现克隆基因表达增高.结论:克隆的人类砷相关基因,编码蛋白质与Alu 亚家族SB序列同源性高.