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miR-3p/5p臂文献资料
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结直肠癌发生发展过程中miRNA 3p、5p臂选择性分析
目的 结直肠癌是常见的消化道肿瘤之一,其致病机制复杂.miRNA成熟体来源于前体的3′或5′臂,而这种miRNA臂的选择性与结直肠癌的发生发展是否相关尚不清楚.方法 本研究利用GEO数据库中8例结直肠癌患者正常肠黏膜组织、结直肠癌组织及肝脏转移组织的miRNA二代测序数据.以Bowtie 2软件将测序数据与miRNA前体序列进行比对.随后,根据比对位置将miRNA归类为miR-5p或miR-3p,并统计miR-3p和miR-5p的reads数,比较不同组织中miR-3p和miR-5p的分布特点.结果 共检测到来自1442个miR-NA前体的miRNA对1057个.在三种组织中miR-3 p和miR-5p的比值均能达到0.9以上,且未见差异.在3p和5p总reads分析中发现相比正常组,肝转移组中成对miRNA的3p/5p的reads比值有显著升高.成对miRNA 3p/5p的read比值分析中发现了8个前体来源的miR-NA的3p/5p比值在不同组织中出现了统计学差异.结论 miRNA的3p和5p的总reads的比值及多个miRNA的3p、5p reads的比值在疾病不同阶段具有显著的变化,该结果提示miR-NA在编辑成熟过程中的3p和5p臂的异常剪切可能与结直肠癌的发生发展密切相关.
关键词： 结直肠癌 转移 miRNA miR-3p/5p臂
