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A-NHEJ与DNA双链断裂修复关系的研究
DNA双链断裂(DNA double strand breaks,DSBs)是诸多DNA损伤类型中对基因组的完整性、稳定性影响严重的一种损伤形式.选择性非同源末端连接(alternative nonhomologous end joining,A-NHEJ)是近研究新发现的一种不依赖Ku蛋白的DSBs修复途径,由于它是一种易错的修复方式,因此能引起基因组不稳定甚至肿瘤发生.本文综述了A-NHEJ的发现以及其修复过程和特点,并介绍了A-NHEJ在染色体易位、端粒融合、V(D)J重排和类别转换重组中的DSBs修复作用.
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Channel catfish重组激活基因克隆与鉴定
目的尝试用简并引物扩增序列未知的channel catfish基因组DNA中ragl基因的片段并测序,为ragl基因的早期进化模式和遗传学变异情况的研究提供直接的证据.方法基于ragl基因的高度保守设计简并引物,PCR扩增channel catfish基因组DNA中ragl基因的片段,TA克隆并双向测序.将所得序列资料拼接,用多种生物信息学方法分析其ORF、内含子、与其它物种ragI基因及Ragl蛋白的相似性,并做多序列比较和系统进化树分析.结果扩增出3条chan-nel catfish ragl基因的DNA片段.从拼接后的序列中找到一2 235bp的ORF和一293bp的内含子,所得序列与其它物种ragl基因的相似程度高(多大于70%),去除内含子后的channel catfish ragl基因序列与zebrafish、rainbow trout、bull shark的ragl基因cDNA全序列碱基一致的位点占43.9%,自第1 352位碱基至2 925位碱基为53.1%,而自第1位碱基至1 351位碱基为33.2%,有非常显著的差异(P＜0.01).结论用简并引物成功扩增出channel catfish ragl基因的DNA片段.序列在GenBank中的登记号是:AY423858(去除内含子序列),AY423859.ragl基因进化缓慢,高度保守,不同物种ragI基因的变异相对集中在氨基末端的区域.系统进化树分析显示了13种硬骨鱼在进化上关系的亲疏.
