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鱼腥草查耳酮合成酶1基因cDNA克隆、差异表达及其蛋白质序列分析
目的 克隆鱼腥草查耳酮合成酶1 (CHSl)基因并分析其蛋白质序列.方法 根据已经克隆的植物CHS基因的保守序列设计一对引物,以鱼腥草总RNA为模板,采用RT-PCR和SON-PCR的方法快速获得CHS基因序列并连接到pMD 18-TSimple载体上,阳性克隆经PCR检测后进行测序.结果 得到一段1 188bp的序列,序列分析表明,该片段编码395个氨基酸,与其他高等植物CHS基因氨基酸序列同源性在62.3%以上,生物信息学分析表明,该蛋白含有CHS家族的特征多肽序列“RLMMYQQGCFAGGTVLR”和“GVLFGFGPGL”,不含信号肽序列.相对荧光定量PCR分析表明,CHS1基因在花中的表达量高,其次是地上茎,再次是地下茎,叶片中表达量低.结论 首次从鱼腥草中克隆了CHS1基因,为有效利用该基因奠定了基础.
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美洲茶藨子查耳酮合成酶基因电子克隆和生物信息学分析
目的:对美洲茶藨子查耳酮合成酶基因进行电子克隆及生物信息学分析.方法:以黑茶藨子查耳酮合成酶基因序列和美洲茶藨子表达序列标签为基本材料(探针),运用CAP3在线软件进行序列拼接,并对其进行了生物信息学分析.结果:美洲茶藨子查耳酮合成酶基因全长1423 bp,包含1173 bp的开放阅读框,编码390个氨基酸,该蛋白是定位于细胞质的亲水性蛋白,存在三处跨膜区,二级结构主要由α-螺旋构成.结论:研究结果有利于美洲茶藨子查耳酮合成酶基因的分子作用机制等方面的研究.